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百岁兰基因组揭示其在沙漠极端干旱环境下的长寿机制

直播日期 2021/09/16 15:00

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百岁兰基因组揭示其在沙漠极端干旱环境下的长寿机制

植物基因组通常较大、高度重复且呈现多种倍性,因而使用短读长测序技术时难以对其进行测序和组装。对长和超长 DNA 片段进行测序时,读长可长达 4 Mb,纳米孔技术能够强化植物基因组组装,从而解析复杂的重复区域、结构变异、转座子和转基因插入。通过对天然 DNA 进行直接、无扩增测序,保留并同步检测修饰碱基及核苷酸序列。
深圳中国科学院仙湖植物园植物研究中心万涛博士与贝纳基因共同合作,利用纳米孔超高通量测序平台PromethION,结合其他测序平台,对裸子植物百岁兰进行染色体水平的基因组组装、甲基化和转录组分析,以探索其生物学特性。研究成果发表在《Nature Communication》。
DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-24528-4
9月16日,我们邀请到深圳中国科学院仙湖植物园植物研究中心万涛博士,在线上分享他们利用纳米孔长读长测序平台进行百岁兰基因组研究的经验和成果。


会议日程

时间 主题 讲师
15:00-15:15 欢迎与纳米孔测序技术介绍 王小薇 Oxford Nanopore 大客户经理
15:15-15:55 百岁兰基因组揭示其在沙漠极端干旱环境下的长寿机制 万涛老师 深圳中国科学院仙湖植物园植物研究中心
15:55-16:00 在线答疑 all


第三期预告:
9.23日 使用Nanopore技术从头组装药用植物地黄基因组 武汉贝纳科技有限公司项目总监 ——牛妍博士
更多信息请持续关注“生物谷”公众号

嘉宾简介

万涛
教授
(中国科学院仙湖植物园植物研究中心)

武汉大学植物学博士,教授级高级工程师,现任深圳市中国科学院仙湖植物园植物研究中心副主管,深圳市南亚热带生物多样性重点实验室副主任,中国科学院中-非联合研究中心骨干科学家,中国科学院武汉植物园客座教授,武汉大学,湖北民族大学校外硕士生导师。万涛课题组长期关注买麻藤类植物的系统演化、生态适应及传粉生物学特征等方面,利用比较基因组学、分子生物学、细胞生物学等学科交叉研究,旨在探讨早期种子植物基因组演化规律及其适应性的进化意义。

王小薇
大客户经理
(Oxford Nanopore Technologies)

厦门大学生物系本科,硕士,上海交大安泰MBA,10年分子生物学和高通量测序领域从业经验。先后就职于华大基因,德国QIAGEN等行业知名企业的研发,技术支持和市场部门。

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